MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. JM

Total Repeats: 8750

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021880	GT	3	6	218929	218934	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_021880	ACAGAA	2	12	219106	219117	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1003	NC_021880	TTA	2	6	221044	221049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_021880	TAC	2	6	222087	222092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_021880	GTTT	2	8	222434	222441	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_021880	CAA	2	6	222525	222530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_021880	ACC	2	6	222544	222549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_021880	ACGC	2	8	222557	222564	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_021880	AAC	2	6	222571	222576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_021880	CAA	2	6	223033	223038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_021880	CTAG	2	8	223151	223158	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_021880	GTG	2	6	223224	223229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_021880	AT	3	6	223296	223301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_021880	ATTCT	2	10	223333	223342	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1015	NC_021880	GTAA	2	8	223407	223414	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_021880	AGC	3	9	223989	223997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_021880	AAC	2	6	224019	224024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_021880	TAG	2	6	224046	224051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_021880	CT	3	6	224073	224078	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_021880	AAT	2	6	224079	224084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_021880	GATTG	2	10	224407	224416	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021880	TAG	2	6	224945	224950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_021880	TAA	2	6	224976	224981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_021880	CAAT	2	8	225134	225141	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1025	NC_021880	AT	3	6	225176	225181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_021880	GCC	2	6	225184	225189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_021880	TGC	2	6	225192	225197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_021880	ATC	2	6	225205	225210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_021880	CTA	2	6	225226	225231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_021880	TAA	2	6	225236	225241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021880	AC	3	6	225260	225265	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_021880	AACA	2	8	225266	225273	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_021880	GGT	2	6	227513	227518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_021880	TGC	2	6	227540	227545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_021880	TGG	2	6	227569	227574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_021880	TTC	2	6	227619	227624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_021880	TGT	2	6	227671	227676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_021880	A	6	6	227694	227699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_021880	TTGT	2	8	227717	227724	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_021880	A	6	6	228514	228519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_021880	TA	3	6	228611	228616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021880	GT	4	8	228630	228637	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_021880	A	7	7	229558	229564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_021880	CTG	2	6	229577	229582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_021880	AGG	2	6	229591	229596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_021880	CTG	2	6	229597	229602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_021880	TAT	2	6	229658	229663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_021880	CTG	2	6	229666	229671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_021880	GTT	2	6	229687	229692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_021880	GTA	2	6	229697	229702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_021880	GTTT	2	8	229716	229723	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_021880	TG	3	6	229811	229816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_021880	AT	3	6	229828	229833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_021880	GTA	2	6	231515	231520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_021880	TCC	2	6	231527	231532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_021880	TAC	2	6	231565	231570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_021880	CATA	2	8	234186	234193	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1058	NC_021880	GTAT	2	8	234198	234205	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_021880	A	6	6	234214	234219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_021880	AC	3	6	234274	234279	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_021880	ATTT	2	8	234293	234300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_021880	AAG	2	6	234354	234359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_021880	TTG	2	6	235172	235177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_021880	TG	3	6	235191	235196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_021880	AGT	2	6	235242	235247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_021880	TCC	2	6	235581	235586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_021880	TGC	2	6	235874	235879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_021880	AGA	2	6	235947	235952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_021880	ACT	2	6	235982	235987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_021880	AGT	2	6	236048	236053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_021880	AGA	2	6	236149	236154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_021880	CCT	2	6	237967	237972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_021880	AACA	2	8	237990	237997	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1074	NC_021880	TCA	2	6	238323	238328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_021880	TA	3	6	238353	238358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_021880	T	6	6	238396	238401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_021880	A	7	7	238420	238426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_021880	AAAG	2	8	238450	238457	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_021880	GT	3	6	238459	238464	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_021880	AGTT	2	8	238484	238491	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_021880	CAC	2	6	238537	238542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_021880	GGA	2	6	239251	239256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_021880	TA	3	6	239302	239307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_021880	ATT	2	6	239313	239318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_021880	GA	3	6	240005	240010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_021880	AATA	2	8	240054	240061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_021880	CTG	2	6	240156	240161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_021880	TACTA	2	10	240191	240200	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1089	NC_021880	GCT	2	6	240269	240274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_021880	CAG	2	6	240279	240284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_021880	TCTT	2	8	240317	240324	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1092	NC_021880	TCT	2	6	240359	240364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_021880	CAG	2	6	240379	240384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_021880	ACA	2	6	241784	241789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_021880	CA	3	6	241788	241793	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1096	NC_021880	ATG	2	6	242530	242535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_021880	T	7	7	244068	244074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_021880	AAT	2	6	244107	244112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_021880	TA	3	6	244119	244124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_021880	AG	3	6	244151	244156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_021880	AAT	2	6	244169	244174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_021880	AT	3	6	244187	244192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_021880	CGAGGA	2	12	244208	244219	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1104	NC_021880	TG	3	6	244277	244282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_021880	TTTG	2	8	244705	244712	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021880	TAA	2	6	248018	248023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_021880	TAC	2	6	248037	248042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_021880	ATA	2	6	248151	248156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_021880	CT	3	6	248193	248198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1110	NC_021880	TAA	2	6	248232	248237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_021880	TAAC	2	8	248257	248264	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1112	NC_021880	CCTAT	2	10	248309	248318	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1113	NC_021880	TTG	2	6	248326	248331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_021880	AAT	2	6	248336	248341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_021880	GTC	2	6	248358	248363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_021880	AGT	2	6	248368	248373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_021880	TAC	2	6	248384	248389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_021880	CAT	2	6	248415	248420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_021880	TA	3	6	248437	248442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_021880	AGT	2	6	248443	248448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_021880	GAA	2	6	248485	248490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_021880	GAG	2	6	248661	248666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_021880	CAA	2	6	248688	248693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_021880	GCT	2	6	248867	248872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_021880	TGA	2	6	248906	248911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_021880	T	6	6	249148	249153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021880	AGT	2	6	249182	249187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_021880	TTC	2	6	249218	249223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_021880	TGC	2	6	249251	249256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_021880	GCA	2	6	249264	249269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_021880	TGT	3	9	249329	249337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_021880	ATAG	2	8	249403	249410	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_021880	GATA	2	8	249438	249445	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_021880	TGT	2	6	249487	249492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_021880	AAG	2	6	249498	249503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_021880	ATAG	2	8	249505	249512	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_021880	GTAG	2	8	249562	249569	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_021880	CGC	2	6	250569	250574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1141	NC_021880	GTA	2	6	250693	250698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1143	NC_021880	AG	3	6	254848	254853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1144	NC_021880	CTGT	2	8	254869	254876	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1148	NC_021880	TTTTG	2	10	258475	258484	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1149	NC_021880	AGT	2	6	259438	259443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1162	NC_021880	AT	3	6	260368	260373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1163	NC_021880	ATT	2	6	262537	262542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1174	NC_021880	T	6	6	265218	265223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1231	NC_021880	TCG	2	6	294159	294164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1234	NC_021880	TG	4	8	294401	294408	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1242	NC_021880	TTGA	2	8	296131	296138	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1243	NC_021880	TTA	2	6	296143	296148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1258	NC_021880	TAC	2	6	301350	301355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1260	NC_021880	GGT	2	6	301405	301410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1261	NC_021880	CTTA	2	8	301416	301423	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1262	NC_021880	TAT	2	6	301775	301780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1268	NC_021880	ACA	2	6	301998	302003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1269	NC_021880	TAT	2	6	302445	302450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1270	NC_021880	GA	3	6	302503	302508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1271	NC_021880	TGA	2	6	302528	302533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1411	NC_021880	TTA	2	6	328280	328285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_021880	T	6	6	328303	328308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_021880	T	7	7	328310	328316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1451	NC_021880	CTT	2	6	337709	337714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1452	NC_021880	CTT	2	6	337767	337772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1465	NC_021880	TG	3	6	338832	338837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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